Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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