Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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