Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms