Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms