Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGB1Q14028 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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