Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB3Q13509 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TUBB3Q13509 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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