Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms