Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms