Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZCCHC9-202ENST00000380199 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SPRR3-201ENST00000295367 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms