RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295367.4

SPRR3-201, Transcript of small proline rich protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRR3, Length 878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3-201ENST00000295367 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SPRR3-201ENST00000295367 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.77■■□□□ 1.72
SPRR3-201ENST00000295367 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPRR3-201ENST00000295367 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SPRR3-201ENST00000295367 FOXD1Q16676 465 aa22.03■■□□□ 1.12
SPRR3-201ENST00000295367 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.05■□□□□ 0.96
SPRR3-201ENST00000295367 POTEDQ86YR6 584 aa20.94■□□□□ 0.94
SPRR3-201ENST00000295367 MSH5O43196 834 aa20.65■□□□□ 0.9
SPRR3-201ENST00000295367 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPRR3-201ENST00000295367 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.36■□□□□ 0.85
SPRR3-201ENST00000295367 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.33■□□□□ 0.85
SPRR3-201ENST00000295367 ADRA2BP18089 450 aa20.2■□□□□ 0.82
SPRR3-201ENST00000295367 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPRR3-201ENST00000295367 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.63■□□□□ 0.57
SPRR3-201ENST00000295367 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.62■□□□□ 0.57
SPRR3-201ENST00000295367 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SPRR3-201ENST00000295367 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPRR3-201ENST00000295367 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.81■□□□□ 0.44
SPRR3-201ENST00000295367 ABCC9O60706 1549 aa17.81■□□□□ 0.44
SPRR3-201ENST00000295367 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SPRR3-201ENST00000295367 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.74■□□□□ 0.43
SPRR3-201ENST00000295367 RNF39Q9H2S5 420 aa17.67■□□□□ 0.42
SPRR3-201ENST00000295367 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SPRR3-201ENST00000295367 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.54■□□□□ 0.4
SPRR3-201ENST00000295367 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SPRR3-201ENST00000295367 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.5■□□□□ 0.39
SPRR3-201ENST00000295367 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.49■□□□□ 0.39
SPRR3-201ENST00000295367 NACADO15069 1562 aa17.45■□□□□ 0.38
SPRR3-201ENST00000295367 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.44■□□□□ 0.38
SPRR3-201ENST00000295367 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.38■□□□□ 0.37
SPRR3-201ENST00000295367 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SPRR3-201ENST00000295367 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.22■□□□□ 0.35
SPRR3-201ENST00000295367 SCRIBQ14160 1630 aa16.92■□□□□ 0.3
SPRR3-201ENST00000295367 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SPRR3-201ENST00000295367 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.89■□□□□ 0.29
SPRR3-201ENST00000295367 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
SPRR3-201ENST00000295367 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SPRR3-201ENST00000295367 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.77■□□□□ 0.28
SPRR3-201ENST00000295367 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.73■□□□□ 0.27
SPRR3-201ENST00000295367 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
SPRR3-201ENST00000295367 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPRR3-201ENST00000295367 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPRR3-201ENST00000295367 DSG3P32926 999 aa16.42■□□□□ 0.22
SPRR3-201ENST00000295367 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SPRR3-201ENST00000295367 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SPRR3-201ENST00000295367 CAPN15O75808 1086 aa16.31■□□□□ 0.2
SPRR3-201ENST00000295367 POTEHQ6S545 545 aa16.29■□□□□ 0.2
SPRR3-201ENST00000295367 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.28■□□□□ 0.2
SPRR3-201ENST00000295367 SMARCA4P51532 1647 aa16.25■□□□□ 0.19
SPRR3-201ENST00000295367 SLC4A2P04920 1241 aa16.2■□□□□ 0.18
SPRR3-201ENST00000295367 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRR3-201ENST00000295367 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRR3-201ENST00000295367 SMARCA2P51531 1590 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRR3-201ENST00000295367 KCNA4P22459 653 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRR3-201ENST00000295367 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.13■□□□□ 0.17
SPRR3-201ENST00000295367 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPRR3-201ENST00000295367 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.09■□□□□ 0.17
SPRR3-201ENST00000295367 NCAPD3P42695 1498 aa16.07■□□□□ 0.16
SPRR3-201ENST00000295367 HMGXB3Q12766 1538 aa16.03■□□□□ 0.16
SPRR3-201ENST00000295367 WIZO95785 1651 aa16.02■□□□□ 0.15
SPRR3-201ENST00000295367 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPRR3-201ENST00000295367 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SPRR3-201ENST00000295367 ABCB7O75027 752 aa15.96■□□□□ 0.15
SPRR3-201ENST00000295367 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPRR3-201ENST00000295367 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPRR3-201ENST00000295367 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SPRR3-201ENST00000295367 APLP2Q06481 763 aa15.83■□□□□ 0.12
SPRR3-201ENST00000295367 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SPRR3-201ENST00000295367 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SPRR3-201ENST00000295367 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.71■□□□□ 0.1
SPRR3-201ENST00000295367 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SPRR3-201ENST00000295367 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.62■□□□□ 0.09
SPRR3-201ENST00000295367 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.62■□□□□ 0.09
SPRR3-201ENST00000295367 CFTRP13569 1480 aa15.59■□□□□ 0.09
SPRR3-201ENST00000295367 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPRR3-201ENST00000295367 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.52■□□□□ 0.08
SPRR3-201ENST00000295367 PRDM2Q13029 1718 aa15.51■□□□□ 0.07
SPRR3-201ENST00000295367 POLA2Q14181 598 aa15.49■□□□□ 0.07
SPRR3-201ENST00000295367 NESP48681 1621 aa15.47■□□□□ 0.07
SPRR3-201ENST00000295367 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPRR3-201ENST00000295367 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.44■□□□□ 0.06
SPRR3-201ENST00000295367 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.41■□□□□ 0.06
SPRR3-201ENST00000295367 ERCC6Q03468 1493 aa15.4■□□□□ 0.06
SPRR3-201ENST00000295367 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.39■□□□□ 0.05
SPRR3-201ENST00000295367 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.34■□□□□ 0.05
SPRR3-201ENST00000295367 ABCC8Q09428 1581 aa15.33■□□□□ 0.05
SPRR3-201ENST00000295367 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SPRR3-201ENST00000295367 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.28■□□□□ 0.04
SPRR3-201ENST00000295367 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
SPRR3-201ENST00000295367 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.23■□□□□ 0.03
SPRR3-201ENST00000295367 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SPRR3-201ENST00000295367 WDR62O43379 1518 aa15.22■□□□□ 0.03
SPRR3-201ENST00000295367 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 TOPBP1Q92547 1522 aa15.19■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 CUX2O14529 1486 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 TOP2BQ02880 1626 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 AKT1S1Q96B36 256 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 CUX1P39880 1505 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRR3-201ENST00000295367 TRIM41Q8WV44 630 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms