Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms