Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms