Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms