Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms