Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms