Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSCP56915 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms