Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms