Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNA2P26232 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms