Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYT1P21579 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms