Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRAFP15056 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms