Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2P0DI81 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC2P0DI81 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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