Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22BO75396 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms