Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTNBO60941 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms