Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF1CO43896 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms