Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALUO43852 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALUO43852 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALUO43852 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms