Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms