Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms