Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms