Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms