Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms