Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms