Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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