Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms