Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP110Q9HB58 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms