Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms