Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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