Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms