Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms