Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms