Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms