Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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