Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms