Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms