Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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