Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms