Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms