Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms