Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC8BQ6P9F7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms