Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms