Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PXDC1Q5TGL8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms